新生兒益生菌給寶寶帶來益處的同時它們也可以促進鈣的吸收，益生菌產生的酸性物質能增加腸道的酸度，益生菌的運動可以增加腸的蠕動，有利于鈣的吸收，益生菌還能分解乳糖和提高蛋白的消化率。

　　在出生后的幾天后，寶寶的胃腸道中就會定植細菌。隨著腸道內、皮膚上正常細菌的寄存，人體的免疫系統就開始啟動、發育，直到基本成熟。嬰兒的腸胃系統占到了免疫系統的三分之二，所以胃腸道中正常菌群的的建立就顯得至關重要。

　　促進腸胃消化，營養吸收。新生兒的腸胃消化能力非常弱。對于很多物質都無法消化。喝益生菌能讓寶寶的腸胃中形成一種短期的菌群。幫助寶寶消化，分解，吸收這些食物中的營養。

　　寶寶自身的腸道免疫力較弱，容易出現腸道感染等情況。益生菌對腸道的特定細胞有促進作用，能刺激免疫功能，從而提高寶寶腸道的免疫力。